| 就役年 | クラスネーム |
| 黎明期の潜水艦 (潜水艇) | |
| 1905年 | "第一潜水艇"型 (ホランド型) |
| 1906年 | "第六潜水艇"型 (ホランド型改) |
| 1909年 | "第八潜水艇" ("C1") 型 |
| 1911年 | "第一〇潜水艇" ("C2") 型 |
| 1912年 | "第一三潜水艇" ("川崎") 型 |
| 1916年 ｜ 1917年 |
"第一六潜水艇" ("C3")型 |
| 1917年 ｜ 1920年 |
"第一四潜水艇" ("S") 型 |
| 1920年 | "第一八潜水艦" ("F1") 型 |
| 1922年 | "第三一潜水艦" ("F2") 型 |
| 第一次大戦時の戦利潜水艦 | |
| (艦籍編入) 1919年 |
"仮称〇一" |
| (艦籍編入) 1919年 |
"仮称〇二" |
| (艦籍編入) 1919年 |
"仮称〇三" |
| (艦籍編入) 1919年 |
"仮称〇四"型 |
| (艦籍編入) 1919年 |
"仮称〇六"型 |
| 海大型潜水艦 (伊号潜水艦) | |
| 1924年 | 海大一 (第四四潜水艦) 型 |
| 1925年 | 海大二 (第五一潜水艦) 型 |
| 1927年 ｜ 1928年 |
海大三a (第六四潜水艦) 型 |
| 1929年 ｜ 1930年 |
海大三b (伊五六) 型 |
| 1929年 ｜ 1930年 |
海大四 (伊六一) 型 |
| 1932年 | 海大五 (伊六五) 型 |
| 1934年 ｜ 1937年 |
海大六a (伊六八) 型 |
| 1938年 | 海大六b (伊七四) 型 |
| 1942年 ｜ 1943年 |
海大七 (伊一七六) 型 |
| 巡潜型 / 特型潜水艦 (伊号潜水艦) | |
| 1926年 ｜ 1929年 |
巡潜一 (伊一) 型 |
| 1932年 | 巡潜一型改 (伊五型) |
| 1935年 | 巡潜二 (伊六) 型 |
| 1937年 ｜ 1938年 |
巡潜三 (伊七) 型 |
| 1941年 ｜ 1942年 |
巡潜甲 (伊九) 型 |
| 1944年 | 巡潜甲型改一 (伊一二) |
| 1944年 ｜ 1945年 |
巡潜甲型改二 (伊一三型) |
| 1940年 ｜ 1943年 |
巡潜乙 (伊一五) 型 |
| 1943年 ｜ 1944年 |
巡潜乙型改一 (伊四〇型) |
| 1944年 | 巡潜乙型改二 (伊五四型) |
| 1940年 ｜ 1944年 |
巡潜丙 (伊一六) 型 |
| 1943年 ｜ 1944年 |
巡潜丙型改 (伊五二型) |
| 1944年 ｜ 1945年 |
潜特 (伊四〇〇) 型 |
| 中・小型潜水艦 (呂号潜水艦) | |
| 1919年 | 海中一 (第一九潜水艦) 型 |
| 1920年 ｜ 1921年 |
海中二 (第二二潜水艦) 型 |
| 1920年 ｜ 1922年 |
海中三 (第三四潜水艦) 型 |
| 1923年 ｜ 1924年 |
海中四 (第四五潜水艦) 型 |
| 1923年 ｜ 1924年 |
特中 (第六八潜水艦) 型 |
| 1920年 | "L1" (第二五潜水艦) 型 |
| 1921年 ｜ 1922年 |
"L2" (第二七潜水艦) 型 |
| 1922年 ｜ 1923年 |
"L3" (第四六潜水艦) 型 |
| 1923年 ｜ 1927年 |
"L4" (第五九潜水艦) 型 |
| 1935年 ｜ 1937年 |
海中五 (呂三三) 型 |
| 1943年 ｜ 1944年 |
中 (呂三五) 型 |
| 1942年 ｜ 1944年 |
潜小 (呂一〇〇) 型 |
| 就役艦無し | 戌 (伊二〇〇) 型 |
| 水中高速型潜水艦 (伊号 / 波号) | |
| 1938年 | 第七一号艦 試験艦 |
| 1944年 ｜ 1945年 |
潜高 (伊二〇一) 型 |
| 1945年 | 潜高小 (波二〇一) 型 |
| 敷設潜水艦 | |
| 1927年 ｜ 1928年 |
機雷潜 (伊二一) 型 |
| 輸送潜水艦 (伊号 / 波号潜水艦) | |
| 1945年 | 潜補 (伊三五一) 型 |
| 1944年 | 潜丁 (伊三六一) 型 |
| 1945年 | 潜丁型改 (伊三七三型) |
| 1944年 ｜ 1945年 |
潜輸小 (波一〇一) 型 |
| 就役艦無し | 潜丁二 ("第二九六八号艦") 型 |
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